MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011988	TGG	2	6	129791	129796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106242
2502	NC_011988	CGGG	2	8	129818	129825	0 %	0 %	75 %	25 %	222106242
2503	NC_011988	GATCG	2	10	129990	129999	20 %	20 %	40 %	20 %	222106242
2504	NC_011988	GCGG	2	8	130007	130014	0 %	0 %	75 %	25 %	222106242
2505	NC_011988	GAC	2	6	130053	130058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106242
2506	NC_011988	ACA	2	6	130063	130068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106242
2507	NC_011988	TGTT	2	8	130069	130076	0 %	75 %	25 %	0 %	222106242
2508	NC_011988	GC	3	6	130128	130133	0 %	0 %	50 %	50 %	222106242
2509	NC_011988	TGG	2	6	130294	130299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106242
2510	NC_011988	CGG	2	6	130307	130312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106242
2511	NC_011988	GCG	2	6	130339	130344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106242
2512	NC_011988	CTG	2	6	130431	130436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106242
2513	NC_011988	GC	3	6	130455	130460	0 %	0 %	50 %	50 %	222106242
2514	NC_011988	TCTG	2	8	130544	130551	0 %	50 %	25 %	25 %	222106243
2515	NC_011988	TGCCT	2	10	130690	130699	0 %	40 %	20 %	40 %	222106243
2516	NC_011988	AGG	2	6	130734	130739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106243
2517	NC_011988	CCT	2	6	130788	130793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106243
2518	NC_011988	CGC	2	6	130853	130858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106243
2519	NC_011988	CGC	2	6	130919	130924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106243
2520	NC_011988	AGC	2	6	131012	131017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106243
2521	NC_011988	TCG	2	6	131077	131082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106243
2522	NC_011988	CGGGTG	2	12	131120	131131	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222106243
2523	NC_011988	G	6	6	131140	131145	0 %	0 %	100 %	0 %	222106243
2524	NC_011988	GC	3	6	131273	131278	0 %	0 %	50 %	50 %	222106243
2525	NC_011988	GCG	2	6	131285	131290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106243
2526	NC_011988	GCT	2	6	131311	131316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106243
2527	NC_011988	GCC	2	6	131414	131419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106243
2528	NC_011988	TGA	2	6	131431	131436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106243
2529	NC_011988	GGC	2	6	131509	131514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106243
2530	NC_011988	GCA	2	6	131559	131564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106243
2531	NC_011988	TC	3	6	131620	131625	0 %	50 %	0 %	50 %	222106243
2532	NC_011988	TGG	2	6	131643	131648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106243
2533	NC_011988	TGG	2	6	131652	131657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106243
2534	NC_011988	TTGCC	2	10	131913	131922	0 %	40 %	20 %	40 %	222106243
2535	NC_011988	TTC	2	6	131983	131988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106243
2536	NC_011988	GCC	2	6	132098	132103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106243
2537	NC_011988	TGGA	2	8	132158	132165	25 %	25 %	50 %	0 %	222106243
2538	NC_011988	AGC	3	9	132189	132197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106243
2539	NC_011988	GTT	2	6	132284	132289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106243
2540	NC_011988	GCG	2	6	132295	132300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106243
2541	NC_011988	GAT	2	6	132305	132310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106243
2542	NC_011988	GGC	2	6	132333	132338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106243
2543	NC_011988	GGCAAT	2	12	132359	132370	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222106243
2544	NC_011988	GGA	2	6	132467	132472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106243
2545	NC_011988	GCG	2	6	132473	132478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106243
2546	NC_011988	CCT	2	6	132523	132528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106243
2547	NC_011988	CTG	2	6	132678	132683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106243
2548	NC_011988	CAT	2	6	132805	132810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106244
2549	NC_011988	CA	3	6	132863	132868	50 %	0 %	0 %	50 %	222106244
2550	NC_011988	CGTT	2	8	132912	132919	0 %	50 %	25 %	25 %	222106244
2551	NC_011988	CCA	2	6	132970	132975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106244
2552	NC_011988	TTA	2	6	132985	132990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106244
2553	NC_011988	GGTG	2	8	133000	133007	0 %	25 %	75 %	0 %	222106244
2554	NC_011988	CGC	2	6	133008	133013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106244
2555	NC_011988	CTG	2	6	133037	133042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106244
2556	NC_011988	GAT	2	6	133048	133053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106244
2557	NC_011988	GCC	2	6	133055	133060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106244
2558	NC_011988	GCT	2	6	133067	133072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106244
2559	NC_011988	ATCT	2	8	133088	133095	25 %	50 %	0 %	25 %	222106244
2560	NC_011988	CCGC	2	8	133119	133126	0 %	0 %	25 %	75 %	222106244
2561	NC_011988	TGA	2	6	133146	133151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106244
2562	NC_011988	CAA	2	6	133156	133161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106244
2563	NC_011988	GCC	2	6	133214	133219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106244
2564	NC_011988	GAT	2	6	133244	133249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106244
2565	NC_011988	TTC	2	6	133313	133318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106244
2566	NC_011988	TGCC	2	8	133351	133358	0 %	25 %	25 %	50 %	222106244
2567	NC_011988	GC	3	6	133361	133366	0 %	0 %	50 %	50 %	222106244
2568	NC_011988	GCG	2	6	133465	133470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106244
2569	NC_011988	CAA	2	6	133513	133518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106244
2570	NC_011988	GGC	2	6	133577	133582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106244
2571	NC_011988	GCG	2	6	133619	133624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106244
2572	NC_011988	TGG	2	6	133684	133689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106244
2573	NC_011988	ATG	2	6	133727	133732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106244
2574	NC_011988	GCA	2	6	133806	133811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106244
2575	NC_011988	TGC	2	6	133959	133964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106244
2576	NC_011988	TGC	2	6	134056	134061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106244
2577	NC_011988	GCG	2	6	134142	134147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106244
2578	NC_011988	GC	3	6	134237	134242	0 %	0 %	50 %	50 %	222106244
2579	NC_011988	GCG	2	6	134291	134296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106244
2580	NC_011988	GCC	2	6	134323	134328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106244
2581	NC_011988	CATG	2	8	134416	134423	25 %	25 %	25 %	25 %	222106244
2582	NC_011988	CT	3	6	134481	134486	0 %	50 %	0 %	50 %	222106244
2583	NC_011988	CG	3	6	134564	134569	0 %	0 %	50 %	50 %	222106244
2584	NC_011988	GCA	2	6	134598	134603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106244
2585	NC_011988	GAT	2	6	134686	134691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106244
2586	NC_011988	CAT	2	6	134748	134753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106244
2587	NC_011988	ATG	2	6	134760	134765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106244
2588	NC_011988	A	6	6	134792	134797	100 %	0 %	0 %	0 %	222106244
2589	NC_011988	GAT	2	6	134877	134882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106244
2590	NC_011988	GTTG	2	8	134895	134902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_011988	AAT	2	6	134946	134951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106245
2592	NC_011988	GCA	2	6	134992	134997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106245
2593	NC_011988	GCC	2	6	135106	135111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106245
2594	NC_011988	CTC	2	6	135187	135192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106245
2595	NC_011988	ATC	2	6	135194	135199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106245
2596	NC_011988	GTT	2	6	135207	135212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106245
2597	NC_011988	ATG	2	6	135248	135253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106245
2598	NC_011988	GCT	2	6	135264	135269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106245
2599	NC_011988	GA	3	6	135352	135357	50 %	0 %	50 %	0 %	222106245
2600	NC_011988	AAT	2	6	135391	135396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106245
2601	NC_011988	GATC	2	8	135471	135478	25 %	25 %	25 %	25 %	222106245
2602	NC_011988	CAG	2	6	135553	135558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106245
2603	NC_011988	GAA	2	6	135619	135624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106245
2604	NC_011988	GCC	2	6	135666	135671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106245
2605	NC_011988	TCT	2	6	135680	135685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106245
2606	NC_011988	GAT	2	6	135775	135780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106245
2607	NC_011988	ATG	2	6	135800	135805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106245
2608	NC_011988	A	6	6	135836	135841	100 %	0 %	0 %	0 %	222106245
2609	NC_011988	ACGC	2	8	135903	135910	25 %	0 %	25 %	50 %	222106245
2610	NC_011988	ATC	2	6	135960	135965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106245
2611	NC_011988	GAT	2	6	135968	135973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106245
2612	NC_011988	A	6	6	135985	135990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011988	TGG	2	6	136138	136143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_011988	TTC	2	6	136164	136169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_011988	ATAA	2	8	136222	136229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_011988	GAAAAT	2	12	136284	136295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_011988	AT	3	6	136294	136299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_011988	TAAA	2	8	136365	136372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_011988	TTTC	2	8	136379	136386	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2620	NC_011988	TGAT	2	8	136406	136413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_011988	GTG	2	6	136444	136449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_011988	CAT	2	6	136480	136485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_011988	CAG	2	6	136508	136513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_011988	GCC	2	6	136592	136597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2625	NC_011988	GTCT	2	8	136729	136736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2626	NC_011988	GAG	2	6	136814	136819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_011988	ACA	2	6	136825	136830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106246
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2725	NC_011988	CGAAG	2	10	142124	142133	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2726	NC_011988	GCA	2	6	142325	142330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106251
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2744	NC_011988	ATGC	2	8	143124	143131	25 %	25 %	25 %	25 %	222106251
2745	NC_011988	GCT	2	6	143140	143145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106251
2746	NC_011988	GTG	2	6	143189	143194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106251
2747	NC_011988	GCG	2	6	143244	143249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106251
2748	NC_011988	CTC	2	6	143254	143259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106251
2749	NC_011988	GC	3	6	143313	143318	0 %	0 %	50 %	50 %	222106251
2750	NC_011988	CTC	2	6	143338	143343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106251
2751	NC_011988	CCT	2	6	143346	143351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106251
2752	NC_011988	TTG	2	6	143429	143434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106251
2753	NC_011988	GAT	2	6	143605	143610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106251
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2755	NC_011988	GCGAT	2	10	143715	143724	20 %	20 %	40 %	20 %	222106251
2756	NC_011988	GCG	2	6	143781	143786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106251
2757	NC_011988	GC	3	6	143822	143827	0 %	0 %	50 %	50 %	222106251
2758	NC_011988	TGC	2	6	143854	143859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106251
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2764	NC_011988	ATC	2	6	144080	144085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106251
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2766	NC_011988	TCAT	2	8	144338	144345	25 %	50 %	0 %	25 %	222106251
2767	NC_011988	CGC	2	6	144435	144440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106251
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2769	NC_011988	ATGT	2	8	144788	144795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2770	NC_011988	TCA	2	6	144804	144809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2771	NC_011988	CAG	2	6	144816	144821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2772	NC_011988	TCATTG	2	12	144846	144857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2773	NC_011988	TCT	2	6	144870	144875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2774	NC_011988	GCC	2	6	144907	144912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2775	NC_011988	ATC	2	6	144940	144945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2776	NC_011988	ATC	2	6	144980	144985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106252
2777	NC_011988	ATCA	2	8	145019	145026	50 %	25 %	0 %	25 %	222106252
2778	NC_011988	CG	3	6	145044	145049	0 %	0 %	50 %	50 %	222106252
2779	NC_011988	TGC	2	6	145224	145229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106252
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2783	NC_011988	CTG	2	6	145466	145471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106252
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2794	NC_011988	TGA	2	6	145942	145947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106252
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2802	NC_011988	A	6	6	146491	146496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2803	NC_011988	TGC	2	6	146532	146537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2853	NC_011988	TAC	2	6	149231	149236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106254
2854	NC_011988	CCG	2	6	149252	149257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106254
2855	NC_011988	CATG	2	8	149261	149268	25 %	25 %	25 %	25 %	222106254
2856	NC_011988	CAC	2	6	149302	149307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106255
2857	NC_011988	GGC	2	6	149329	149334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106255
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2862	NC_011988	ATC	2	6	149597	149602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106255
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2866	NC_011988	CT	3	6	149669	149674	0 %	50 %	0 %	50 %	222106255
2867	NC_011988	ATT	2	6	149697	149702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106255
2868	NC_011988	GCT	2	6	149806	149811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106255
2869	NC_011988	CAT	2	6	149857	149862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106255
2870	NC_011988	GTTGCC	2	12	149864	149875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106255
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2872	NC_011988	TGG	2	6	149937	149942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106255
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2878	NC_011988	CCAT	2	8	150207	150214	25 %	25 %	0 %	50 %	222106255
2879	NC_011988	GCC	2	6	150245	150250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106255
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2977	NC_011988	CGTCAC	2	12	154914	154925	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106259
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2982	NC_011988	ACCGC	2	10	155047	155056	20 %	0 %	20 %	60 %	222106259
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2985	NC_011988	ATCA	2	8	155213	155220	50 %	25 %	0 %	25 %	222106260
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2988	NC_011988	ATA	2	6	155310	155315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106260
2989	NC_011988	CAA	2	6	155360	155365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106260
2990	NC_011988	GGC	2	6	155368	155373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106260
2991	NC_011988	CCA	2	6	155418	155423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106260
2992	NC_011988	CGC	2	6	155453	155458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106260
2993	NC_011988	TGG	2	6	155560	155565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106260
2994	NC_011988	GGCA	2	8	155591	155598	25 %	0 %	50 %	25 %	222106260
2995	NC_011988	CAA	2	6	155626	155631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106260
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2997	NC_011988	CCA	2	6	155779	155784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106260
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2999	NC_011988	CAG	2	6	155828	155833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106260
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